Gracz, po raz kolejny wciela się w postać agenta 47, który działa na zlecenie agencji ICA. Gra składa się z trzynastu misji - zabójstw w różnych częściach świata. Sposób eliminacji celu zależy od gracza. Aby uzyskać najlepszy wynik należy eliminować cele pozostając niezauważonym. Ważna jest umiejętność obserwacji, myślenie i celne strzelanie. Do dyspozycji bohater ma pistolet, truciznę, ładunki wybuchowe i wiele innych.